Este Programa surge institucionalmente en 1990, especializándose en la defensa de los derechos humanos de los niños, niñas y adolescentes, en la promoción de su condición como sujetos de derecho, y en la dirección de proyectos para familias en circunstancias especialmente difíciles con el interés de mejorar su nivel y calidad de vida.

Su surgimiento a nivel institucional como Programa obedece al marcado interés de varios equipos de profesionales que, con vasta experiencia en la atención a la niñez, estaban directamente involucrados y comprometidos con este sector poblacional.

Durante el año 2003, el Programa para la Promoción de la Familia y la Comunidad administró 12 proyectos (un 27.9% del total que administra la institución a nivel nacional) dirigidos a los niños, niñas y adolescentes entre los cuales podríamos destacar el Proyecto para la Defensa de los Derechos de la Niñez y la Adolescencia en el Mercado R. Huembes, financiado por Save the Children, Suecia, y el Proyecto de Protección y Prevención de Explotación Sexual Comercial para Niños, Niñas y Adolescentes que trabajan en los Mercados de la ciudad de Managua financiado por la Iglesia Presbiteriana de Canadá.